public AmbiguityRNACompoundSet() { addNucleotideCompound("A", "U"); addNucleotideCompound("U", "A"); addNucleotideCompound("G", "C"); addNucleotideCompound("C", "G"); addNucleotideCompound("M", "K", "A", "C"); addNucleotideCompound("R", "Y", "A", "G"); addNucleotideCompound("W", "W", "A", "U"); addNucleotideCompound("S", "S", "C", "G"); addNucleotideCompound("Y", "R", "C", "U"); addNucleotideCompound("K", "M", "G", "U"); addNucleotideCompound("V", "B", "A", "C", "G"); addNucleotideCompound("H", "D", "A", "C", "U"); addNucleotideCompound("D", "H", "A", "G", "U"); addNucleotideCompound("B", "V", "C", "G", "U"); addNucleotideCompound("N", "N", "A", "C", "G", "U", "M", "R", "W", "S", "Y", "K", "V", "H", "D", "B"); calculateIndirectAmbiguities(); }
public AmbiguityRNACompoundSet() { addNucleotideCompound("A", "U"); addNucleotideCompound("U", "A"); addNucleotideCompound("G", "C"); addNucleotideCompound("C", "G"); addNucleotideCompound("M", "K", "A", "C"); addNucleotideCompound("R", "Y", "A", "G"); addNucleotideCompound("W", "W", "A", "U"); addNucleotideCompound("S", "S", "C", "G"); addNucleotideCompound("Y", "R", "C", "U"); addNucleotideCompound("K", "M", "G", "U"); addNucleotideCompound("V", "B", "A", "C", "G"); addNucleotideCompound("H", "D", "A", "C", "U"); addNucleotideCompound("D", "H", "A", "G", "U"); addNucleotideCompound("B", "V", "C", "G", "U"); addNucleotideCompound("N", "N", "A", "C", "G", "U", "M", "R", "W", "S", "Y", "K", "V", "H", "D", "B"); calculateIndirectAmbiguities(); }